Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC030500E9Q6W0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms