Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga10E9Q6R1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga10E9Q6R1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga10E9Q6R1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga10E9Q6R1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga10E9Q6R1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga10E9Q6R1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga10E9Q6R1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga10E9Q6R1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms