Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms