Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17727E9Q4V7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17727E9Q4V7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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