Protein–RNA interactions for Protein: E9Q289

Acbd4, Acyl-Coenzyme A-binding domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd4E9Q289 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Acbd4E9Q289 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms