Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms