Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Zfp558E9Q1J0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Zfp558E9Q1J0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Zfp558E9Q1J0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Zfp558E9Q1J0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Zfp558E9Q1J0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Zfp558E9Q1J0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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