Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddx60E9PZQ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddx60E9PZQ1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddx60E9PZQ1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddx60E9PZQ1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddx60E9PZQ1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddx60E9PZQ1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx60E9PZQ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx60E9PZQ1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx60E9PZQ1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddx60E9PZQ1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Ddx60E9PZQ1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Ddx60E9PZQ1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx60E9PZQ1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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