Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms