Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms