Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms