Protein–RNA interactions for Protein: E9PW05

Zfp54, Zinc finger protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp54E9PW05 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp54E9PW05 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms