Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cngb1E1AZ71 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms