Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444G20RikD3Z741 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930444G20RikD3Z741 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms