Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh8D3Z6W3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms