Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vpreb3D3Z6J4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb3D3Z6J4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms