Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9630041A04RikD3Z3U4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
9630041A04RikD3Z3U4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms