Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms