Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kif28pD3YXS5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms