Protein–RNA interactions for Protein: D3YUU6

Crnn, Cornulin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrnnD3YUU6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CrnnD3YUU6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CrnnD3YUU6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms