Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm4950D3YUM8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm4950D3YUM8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm4950D3YUM8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm4950D3YUM8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4950D3YUM8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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