Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmf1B9EKI3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmf1B9EKI3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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