Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd8B9EJ80 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms