Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppfia4B8QI36 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia4B8QI36 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms