Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf11cB4XVP9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms