Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms