Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cspp1B2RX88 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms