Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cfap58B2RW38 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cfap58B2RW38 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms