Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtprbB2RU80 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprbB2RU80 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprbB2RU80 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprbB2RU80 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PtprbB2RU80 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprbB2RU80 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms