Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud4B2RRE7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud4B2RRE7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms