Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H60cB1B213 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H60cB1B213 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H60cB1B213 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms