Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mbd5B1AYB6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd5B1AYB6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms