Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms