Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NhsB1AV60 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NhsB1AV60 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NhsB1AV60 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms