Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms