Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf2A3KGV1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms