Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf39A2RT81 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf39A2RT81 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms