Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms