Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf2A2AT37 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms