Protein–RNA interactions for Protein: A2ARK0

Fam83c, Protein FAM83C, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83cA2ARK0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83cA2ARK0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83cA2ARK0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms