Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SetxA2AKX3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms