Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Hmcn2A2AJ76 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms