Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms