Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm16A2A935 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm16A2A935 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms