Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb4A2A863 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms