Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms