Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdc27A2A6Q5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms