Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc173A0JLY1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms