Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930469K13RikA0A286YDB2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms