Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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